Гаев отказался прокомментировать факт возбуждения уголовного дела.
Уголовного преследования Гаева добивалась Генпрокуратура. В середине февраля это ведомство направило в СК при МВД России материалы проверки, в ходе которой были выявлены многочисленные нарушения.
Согласно выводам Генпрокуратуры, "Гаев создал систему личного обогащения за счет возглавляемой им организации" в результате чего Московскому метрополитену и правительству Москвы был причинен ущерб на сумму свыше 112 миллионов рублей.
Генпрокуратура обнаружила, что руководство метрополитена незаконно сдавало в аренду помещения, скрывало происшествия в метро, а также необоснованно завышало цены на проездные билеты.
Гаев ушел в отставку по собственной инициативе 7 февраля. Его место занял бывший начальник Калининградской железной дороги Иван Беседин.